В ходе совещания было отмечено, что в соответствии с публичными разъяснениями представителей Министерства здравоохранения НДС должен начисляться сверх предельной цены на лекарственные средства, а не включаться в её структуру. При этом участники совещания подчеркнули, что действующие правила формирования предельных цен требуют нормативного уточнения.

Заместитель председателя Комитета государственных доходов (КГД) МФ РК Ж.М. Нуржанов пояснил, что согласно приказу Министерства здравоохранения РК от 11 декабря 2020 года №ҚР ДСМ-247/2020 «Об утверждении правил регулирования, формирования предельных цен и наценки на лекарственные средства, а также медицинские изделия в рамках ГОБМП и (или) в системе ОСМС», предельные цены изначально не включают НДС. Однако в данном НПА должно быть прямо зафиксировано, что предельная цена формируется без НДС. По его словам, приказ с этими уточнениями необходимо как можно быстрее доработать и утвердить. До появления таких уточнений налоговые органы будут исходить из действующей логики налогообложения: НДС будет исчисляться исходя из фактической цены реализации.

Представители КГД также обратили внимание на риски для бизнеса в случае, если НДС будет «встроен» в предельную цену. В такой ситуации налог будет фактически изыматься из маржи участников рынка, что особенно чувствительно для аптечных организаций и дистрибьюторов. Отдельно была обозначена проблема различий между аптеками - плательщиками НДС и теми, кто работает в упрощённом налоговом режиме. В условиях введения налога это приводит к ситуации, при которой одна аптека, не начисляющая НДС, будет реализовывать лекарственный препарат, условно, по цене 100 тенге, тогда как соседняя аптека - плательщик НДС - вынуждена будет отпускать тот же препарат по цене 105 тенге. По мнению участников обсуждения, такая разница формирует внутренний ценовой дисбаланс в розничном сегменте и создаёт неравные конкурентные условия для аптечных организаций, работающих в рамках одного рынка.

Со стороны регулятора в сфере здравоохранения было разъяснено, что действующие предельные цены утверждались в 2025 году, в период, когда лекарственные средства не облагались НДС, и потому не содержат налоговой составляющей. 

Участники рынка подчеркнули, что отсутствие утверждённых изменений в приказе № 247 уже приводит к сдерживанию поставок и реализации лекарственных средств, поскольку бизнес опасается превышения предельных цен. В этой связи по итогам совещания была поддержана инициатива о подготовке временного официального письма-разъяснения со стороны КМФК, которое подтвердит правомерность реализации лекарственных средств по формуле «предельная цена + НДС» до утверждения обновлённых правил.

Принятие такого разъяснения рассматривается участниками совещания как необходимая мера для стабилизации фармацевтического рынка в переходный период действия нового Налогового кодекса и завершения нормативного контура ценового и налогового регулирования.