Дополнительно постановлением Правительства Республики Казахстан от 31 декабря 2025 года №1203 утверждён комплекс перечней и правил, формирующих правовую основу освобождения от НДС в сфере здравоохранения. В частности, постановлением утверждены:
- перечень медицинских услуг, в том числе оказываемых в комплексе в соответствии с законодательством Республики Казахстан субъектами здравоохранения, имеющими лицензию на медицинскую деятельность, в рамках гарантированного объёма бесплатной медицинской помощи (ГОБМП) и обязательного социального медицинского страхования (ОСМС), а также для лечения орфанных и социально значимых заболеваний, обороты по реализации которых освобождаются от НДС;
- перечень лекарственных средств, реализуемых в рамках ГОБМП и ОСМС, а также применяемых для лечения орфанных и социально значимых заболеваний, обороты по реализации которых освобождаются от НДС;
- перечень лекарственных средств, предназначенных для ГОБМП и ОСМС, а также для лечения орфанных и социально значимых заболеваний, импорт которых освобождается от НДС;
- Правила применения освобождения от НДС при импорте лекарственных средств в рамках ГОБМП и ОСМС, а также для лечения орфанных и социально значимых заболеваний.
Постановление № 1203 также вводится в действие с 1 января 2026 года.
Ожидается также выход постановления Правительства РК, которым будет утвержден Перечень лекарственных средств, медицинских изделий, комплектующих медицинских изделий, а также технических вспомогательных (компенсаторных) средств, в соответствии с законодательством Республики Казахстан о социальной защите. Данные нормативно-правовые акты имеют системное значение для функционирования фармацевтического и медицинского рынков. Они формируют законодательный контур налогообложения и освобождения от НДС лекарственных средств, медицинских изделий и медицинских услуг в условиях перехода на новое налоговое законодательство Республики Казахстан и создают правовую определённость для импортеров, производителей, дистрибьюторов, медицинских организаций и аптечного сектора.
Однако ключевым элементом завершения нормативного контура остаётся выход обновлённого приказа Министерства здравоохранения РК от 11 декабря 2020 года №ҚР ДСМ-247/2020 «Об утверждении правил регулирования, формирования предельных цен и наценки на лекарственные средства, а также медицинские изделия в рамках ГОБМП и (или) в системе ОСМС». Именно в этом документе должно быть однозначно и прямо зафиксировано, что НДС начисляется сверх установленной предельной цены и не включается в её структуру. Отсутствие утверждённой редакции данных правил продолжает создавать риски для импортеров, оптового звена и аптечных организаций.
В настоящее время, по итогам проведённых совещаний с участием представителей уполномоченных органов и отраслевого сообщества, принято решение о предоставлении участникам фармацевтического рынка официального письма-разъяснения со стороны Комитет медицинского и фармацевтического контроля МЗ РК. В указанном письме планируется прямо зафиксировать позицию регулятора о том, что НДС начисляется сверх установленной предельной цены и не включается в её структуру. Данное разъяснение должно быть направлено на снижение правовой неопределённости до выхода обновленной редакции приказа Министра здравоохранения РК от 11 декабря 2020 года № ҚР ДСМ-247/2020.
Эти решения рассматриваются как критически важные для синхронизации ценового и налогового регулирования, а также для предотвращения экономических потерь и искажений в цепочке обращения лекарственных средств в переходный период действия нового Налогового кодекса.